수행사례통합2026. 06. 16

국가연구개발사업 연구개발비 부정사용 / 참여제한 및 환수 처분 취소 판결

업무사례 추가정보

결과

행정소송 승소

사건경위	국가연구개발사업 수행 중 규정 해석의 차이로 '연구비 부정사용' 혐의를 받아, 과학기술정보통신부로부터 사업 참여제한 및 제재부가금 부과 처분을 받은 사례입니다.
특이사항	단순 행정 실무상의 미숙함을 고의적 편취로 간주한 행정청의 가혹한 처분에 맞서, 법리적 허점을 찔러 처분 '전부 취소'를 이끌어냈습니다.
결과	참여제한 및 환수 처분 취소 판결

1. 사건 경위

의뢰인은 수년간 국가 IT 산업 발전을 위해 헌신해 온 연구기관으로, 과학기술정보통신부 산하 기관에서 주관하는 국가연구개발사업 을 수행해 왔습니다. 그러나 최근 과기부로부터 국가연구개발혁신법 제32조 및 제34조에 근거하여, '연구개발비 부정사용' 을 이유로 한 국가연구개발사업 참여제한 및 연구개발비 환수 처분과 더불어 고액의 제재부가금 부과 처분 을 통보받았습니다.

과기부는 의뢰인이 연구 과제와 직접적인 관련이 없는 용도로 연구비를 지출했다고 판단했으나, 이는 복잡한 행정 절차와 규정 해석의 차이에서 발생한 실무적인 착오였습니다. 만약 이 처분이 확정될 경우, 의뢰인은 향후 수년간 모든 국가 연구 과제에 참여할 수 없게 되어 기관의 존폐가 위태로운 상황이었기에, 행정법률 분야의 전문성을 갖춘 법무법인 마중 에 사건을 의뢰하셨습니다.

2. 사건의 쟁점 및 마중의 전략

이 사건의 핵심은 연구비 사용 행위가 법령에서 정한 '부정사용'의 고의성이 있었는지, 그리고 처분의 수위가 위반 행위의 정도에 비해 과도하지 않은지 여부 였습니다. 마중은 다음과 같은 전략으로 대응했습니다.

RESPONSE

① 사실관계의 재구성 및 고의성 부정

마중은 해당 지출이 연구 수행 과정에서 필수적으로 수반된 비용이었음을 입증하기 위해, 수년간의 회계 자료와 연구 일지를 면밀히 분석했습니다. 이를 통해 해당 예산 집행이 개인적인 유용이나 편취가 아닌, 연구 목표 달성을 위한 효율적인 예산 운용 과정에서 발생한 절차적 미숙이었음을 논리적으로 증명 했습니다.

② 법령 해석의 오류 지적

국가연구개발혁신법상 '부정사용'의 범위를 행정청이 지나치게 포괄적으로 해석했다는 점을 짚어냈습니다. 단순한 행정상의 실수나 규정 미숙지에 의한 예산 편성 오류를 '연구비 편취'와 동일하게 보아 무거운 참여제한 처분을 내리는 것은 행정권의 남용 임을 강력히 피력했습니다.

③ 재량권 일탈·남용

설령 일부 절차상 미비점이 인정된다 하더라도, 참여제한 처분은 연구기관에 사실상 '사형 선고'와 다름없다는 점을 강조했습니다. 의뢰인이 그동안 국가 IT 발전에 기여해 온 공로와 이번 사고가 초범인 점, 그리고 제재부가금의 액수가 위반 정도에 비해 지나치게 가혹하다는 점 을 입증하는 자료를 제출했습니다.

3. 사건 결과 및 의뢰인 이익

RESULT

법무법인 마중의 치밀한 법리 검토와 현장 중심의 대응 결과, 재판부는 마중의 주장을 받아들여 과학기술정보통신부가 내린 참여제한 처분 및 연구개발비 환수 처분과 더불어 제재부가금 부과처분 전부를 취소하는 판결 을 내렸습니다.

이 판결을 통해 의뢰인은 고액의 제재부가금 부담에서 벗어난 것은 물론, 국가연구개발사업에 계속해서 참여할 수 있는 자격을 유지하게 되었습니다. 중단될 위기에 처했던 연구 과제들을 지속할 수 있게 됨으로써 기관의 신뢰도와 전문성을 지켜낼 수 있었습니다.

4. 사건의 의의

국가연구개발사업은 규정이 매우 복잡하고 엄격하여, 연구 현장에서의 실무적인 판단이 자칫 '부정사용'으로 오해받는 경우가 많습니다. 이번 사건은 행정청의 일방적인 잣대로 연구자의 자율성과 연구 기관의 생존권을 침해해서는 안 된다는 원칙을 확인했다는 점에서 의미가 큽니다.

국가기관을 상대로 하는 행정 소송은 법리에 대한 해박한 지식뿐만 아니라, 해당 산업군에 대한 깊은 이해가 필수적입니다. 법무법인 마중은 국가연구개발혁신법을 비롯한 다양한 행정 법규에 대한 전문성을 바탕으로 , 의뢰인이 억울한 처분으로 연구 인생의 위기를 겪지 않도록 최선의 결과를 이끌어냅니다. 비슷한 고민을 하고 계신 연구자나 기관이 있다면, 행정 특화 법무법인 마중 과 함께 해결책을 찾으시길 바랍니다. 감사합니다.